國家食品安全危害分析與關鍵控制點應用研究中心主要開展食品安全危害分析與關鍵控制點的基礎性、應用性研究；為政府和企業解決食品鏈質量安全控制體系監督管理和實施過程中遇到的各類問題；開展與食品鏈質量安全控制技術相關的培訓、效果評價、咨詢等社會服務；構建食品鏈質量安全控制技術的教育平臺和交流平臺。